Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip4Q9QXN3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms