Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Limd1Q9QXD8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Limd1Q9QXD8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms