Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cyth1Q9QX11 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cyth1Q9QX11 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cyth1Q9QX11 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms