Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tcea2Q9QVN7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcea2Q9QVN7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcea2Q9QVN7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms