Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc4Q9QUQ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms