Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cabp1Q9JLK7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Cabp1Q9JLK7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cabp1Q9JLK7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cabp1Q9JLK7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms