Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msrb1Q9JLC3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msrb1Q9JLC3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msrb1Q9JLC3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msrb1Q9JLC3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msrb1Q9JLC3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msrb1Q9JLC3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msrb1Q9JLC3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msrb1Q9JLC3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Msrb1Q9JLC3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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