Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prg3Q9JL95 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prg3Q9JL95 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prg3Q9JL95 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms