Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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Gde1Q9JL56 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gde1Q9JL56 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Gde1Q9JL56 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Gde1Q9JL56 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gde1Q9JL56 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gde1Q9JL56 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms