Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Habp4Q9JKS5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Habp4Q9JKS5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms