Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nova1Q9JKN6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nova1Q9JKN6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms