Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ndufaf3Q9JKL4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ndufaf3Q9JKL4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ndufaf3Q9JKL4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms