Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx6Q9JKK1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx6Q9JKK1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx6Q9JKK1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms