Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Scamp5Q9JKD3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Scamp5Q9JKD3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scamp5Q9JKD3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms