Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms