Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms