Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copb1Q9JIF7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copb1Q9JIF7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms