Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EefsecQ9JHW4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EefsecQ9JHW4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms