Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tmod3Q9JHJ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmod3Q9JHJ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms