Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn12Q9ET43 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn12Q9ET43 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn12Q9ET43 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms