Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim54Q9ERP3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim54Q9ERP3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms