Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cxcr6Q9EQ16 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cxcr6Q9EQ16 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms