Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trmt112Q9DCG9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt112Q9DCG9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt112Q9DCG9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms