Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MNCb-2875Q9DCB3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms