Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cbx6Q9DBY5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cbx6Q9DBY5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cbx6Q9DBY5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cbx6Q9DBY5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms