Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tysnd1Q9DBA6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tysnd1Q9DBA6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms