Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Asf1bQ9DAP7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Asf1bQ9DAP7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms