Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cmtm2bQ9DAC0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cmtm2bQ9DAC0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms