Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Usp12Q9D9M2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Usp12Q9D9M2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp12Q9D9M2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms