Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tspan13Q9D8C2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan13Q9D8C2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms