Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp4bQ9D8B3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp4bQ9D8B3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp4bQ9D8B3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms