Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Kctd4Q9D7X1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Kctd4Q9D7X1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms