Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn22Q9D7U6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms