Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmigd1Q9D7L8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmigd1Q9D7L8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmigd1Q9D7L8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms