Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2310002L09RikQ9D7L5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2310002L09RikQ9D7L5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2310002L09RikQ9D7L5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
2310002L09RikQ9D7L5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
2310002L09RikQ9D7L5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2310002L09RikQ9D7L5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
2310002L09RikQ9D7L5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
2310002L09RikQ9D7L5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
2310002L09RikQ9D7L5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms