Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4cQ9D7F7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4cQ9D7F7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms