Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpap3Q9D706 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rpap3Q9D706 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpap3Q9D706 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms