Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MsraQ9D6Y7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MsraQ9D6Y7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms