Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Borcs8Q9D6Y4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms