Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lpcat2bQ9D5U0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms