Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb1Q9D5L7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb1Q9D5L7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb1Q9D5L7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb1Q9D5L7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb1Q9D5L7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb1Q9D5L7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spsb1Q9D5L7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spsb1Q9D5L7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spsb1Q9D5L7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms