Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrameQ9D4Z5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PrameQ9D4Z5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrameQ9D4Z5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms