Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930556J24RikQ9D4U7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
4930556J24RikQ9D4U7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms