Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clvs1Q9D4C9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clvs1Q9D4C9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms