Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D454 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D454 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D454 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D454 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D454 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D454 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D454 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D454 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D454 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D454 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D454 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D454 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D454 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D454 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D454 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D454 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D454 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D454 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D454 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D454 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D454 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D454 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D454 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D454 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D454 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D454 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D454 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D454 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D454 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D454 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D454 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D454 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D454 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D454 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D454 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D454 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D454 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D454 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D454 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D454 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D454 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D454 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D454 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D454 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D454 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D454 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D454 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D454 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D454 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D454 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D454 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D454 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D454 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D454 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D454 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D454 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D454 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms