Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cfap53Q9D439 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap53Q9D439 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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