Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx29Q9D3S3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx29Q9D3S3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx29Q9D3S3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms