Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ms4a4cQ9D3F6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4cQ9D3F6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms