Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp35Q9D384 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snrnp35Q9D384 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snrnp35Q9D384 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms