Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700034E13RikQ9D2T6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700034E13RikQ9D2T6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms